Thousand Islands ist ein kleiner Park mit vielen Teilen: Inseln und Felseninseln im Sankt-Lorenz-Strom, dazu drei Grundstücke am Festland.
Wie viele Inseln es genau sind, sagt die Parkverwaltung je nach Seite verschieden: Die Seite zu den Einrichtungen zählt 19 Inselgrundstücke, die Geschichtsseite mehr als 20 Inseln und rund 90 Felseninseln, die Forschungsseite 26 Inseln und 80 Felseninseln. Gemeinsam ist allen Angaben: mehr als zwanzig Inseln zwischen Kingston und Brockville und mehrere Grundstücke am Festland.
Die Lage auf dem Frontenac-Bogen macht den Park zu einem der artenreichsten Kanadas. Die Inseln bilden eine Kette von Trittsteinen über den Strom und verkürzen die Wege zwischen den Landmassen — ein Korridor zwischen den Adirondacks und dem Algonquin Park. Die Parkverwaltung misst die Gesundheit von Wald, Feuchtgebiet und Fließgewässer an fünfzehn ökologischen Kennwerten.
Zu den häufigsten Tieren am Wasser zählen Fischadler, Landkarten-Höckerschildkröten, Nerze, Kanadareiher und Weißwedelhirsche. An einem einzigen Tag wurden auf Grenadier Island 102 Vogelarten bestimmt; der Sankt-Lorenz-Strom mildert das Klima so weit, dass sich nördliche Arten wie der Eistaucher und südliche wie der Truthahngeier begegnen.
Menschen kommen seit dem Ende der letzten Eiszeit im Sommer hierher. 1979 fand ein Taucher vor Grenadier Island einen Tontopf der Point-Peninsula-Kultur, die vor rund 2.500 Jahren lebte. Französische Berichte des 17. Jahrhunderts beschreiben Sommerlager mit hunderten Menschen, darunter Onondaga, und eine große Aalfischerei zwischen Mallorytown Landing und Ivy Lea. Nach 1784 siedelten europäische Familien; ab den 1860er Jahren gingen die Fischbestände zurück. Heute forscht der Park gemeinsam mit den Mohawks of Akwesasne.
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